Nguồn kinh phí này sẽ được hỗ trợ 16 huyện thuộc vùng trọng điểm mưa lũ gây thiệt hại nặng; trong đó tập trung hỗ trợ về cây trồng, vật nuôi và nuôi trồng thuỷ, hải sản. Do khó khăn về kinh phí nên trong đợt 1, tỉnh tạm cấp 19,565 tỷ cho các địa phương; trong đó 6 huyện bị thiệt hại nặng nề gồm Nông Cống, Triệu Sơn, Thọ Xuân, Yên Định, Lang Chánh và Thường Xuân được tạm ứng 70% số tiền hỗ trợ, các huyện còn lại được tạm ứng 50% số tiền được hỗ trợ.
Ngoài mức hỗ trợ thiệt hại cây trồng theo thông tư của Bộ Tài chính, tỉnh cũng quy định rõ mức hỗ trợ đối với các thiệt hại khác. Cụ thể như thiệt hại gia cầm được tỉnh hỗ trợ 7.000 đồng/con; diện tích nuôi trồng bị thiệt hại từ 30%-70% được hỗ trợ 1 triệu đồng/ha; diện tích nuôi trồng bị thiệt hại trên 70% được hỗ trợ 3 triệu đồng/ha. Đợt này, tỉnh cũng hỗ trợ 12 tỷ đồng cho huyện Thọ Xuân để khắc phục khẩn cấp hệ thống đê điều, thuỷ lợi.
Đợt mưa lũ đầu tháng 9 vừa qua đã gây thiệt hại cho Thanh Hóa ước tính 907 tỷ đồng, trong đó có 24.320 ha cây trồng, 3.392 ha nuôi trồng thuỷ hải sản bị thiệt hại, gần 107.000 con gia cầm bị chết./.