Giai đoạn hai của dự án này, dự kiến sẽ được tiến hành từ tháng 9/2013 và kéo dài trong 3 năm, với tổng ngân sách lên tới 393 triệu yên Nhật (tương đương 4,17 triệu USD).
Dự án tập trung vào việc tăng cường các biện pháp phòng chống thiên tai liên quan tới nước bằng hệ thống quản lý lũ lụt tổng hợp.
Tại buổi lễ ký kết, Thứ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn kiêm Tổng cục trưởng Tổng cục Thủy lợi Hoàng Văn Thắng cho biết, dự án trên đã thực hiện xong giai đoạn 1 và mang lại hiệu quả thiết thực, năng lực tổ chức quản lý thiên tai cấp tỉnh, huyện và xã đã được nâng cao.
Đánh giá về thành tích của giai đoạn đầu, Thứ trưởng Hoàng Văn Thắng nhìn nhận, dự án đã xây dựng, hướng dẫn tăng cường các mô hình về quản lý thiên tai lấy cộng đồng làm trung tâm, áp dụng và phát triển các công nghệ phù hợp cho các biện pháp phi công trình chống sạt lở bờ sông chi phí thấp quy mô nhỏ được phát triển.
Sau khi dự án giai đoạn 1 hoàn thành (từ năm 2009-2012,) Chính phủ Việt Nam đã tiếp tục đề xuất JICA triển khai dự án “Nâng cao năng lực thích ứng với thiên tại ở Việt Nam-giai đoạn 2.”
Để chuẩn bị cho giai đoạn triển khai thực hiện dự án, JICA sẽ phối hợp với Bộ Nông nghiệp và phát triển nông thôn, các cơ quan liên quan khác của Chính phủ Việt Nam cùng chính quyền địa phương của các tỉnh Thừa Thiên Huế, Nghệ An, Hà Tĩnh, Quảng Bình tiến hành ký kết Bản thỏa thuận dự án, làm cơ sở cho việc thực hiện dự án sau này./.